AMBER Data Reduction Software
Introduction
Le but de cette activité consiste à reprendre le plugin existant ammyorick, et :- d'intégrer le plugin dans le module amdlib,
- de mettre en place la génération automatique du wrapper des fonctions de la librarie de réduction de données amdlib,
- d'extraire, remettre en forme et documenter les fonctions Yorick strictement nécessaires à la réduction des données AMBER,
- d'extraire le plugin cftisio, et le placer dans le module yoco ; module des contributions Yorick du LAOG
- d'extraire les fonctions d'usage général du module et le placer dans le module yoco
- de décomposer la procédure check data quality (voir réunion du 13 février),
- calcul des visibilités brutes,
- sélection d'images,
- calcul des visibilités moyennées
- calcul de visibilités calibrées
- visionneur de fichiers OI-FITS s'adaptant au contenu
- d'intégrer la génération (non basée sur Latex) du fichier pdf au visionneur
- de fournir une procédure d'installation simplifiée
- de finaliser la documentation utilisateur
Procédure d'installation
La procédure d'installation a été simplifiée, et est décrite sur la page suivanteDocumentation utilisateur
La documentation utilisateur doit :- refléter la dernière version du logiciel,
- inclure des exemples,
- préciser les limites d'utilisation,
- fournir les justifications scientifiques (référence aux publications)
Liste des beta-testeurs
- Emmanuel Di Folco (Emmanuel.DiFolco@obs.unige.ch)
- Jörg-Uwe Pott (pott@ph1.uni-koeln.de)
- Olivier Chesneau (Olivier.Chesneau@obs-azur.fr)
Action en cours
%ACTION{ closed="22-Mar-2007" closer="" created="13-Nov-2006" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000175" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF Creer la page Web et mettre en ligne pour le telechargement du logiciel AMBER DRS J'ai rajoute une partie des fichiers necessaires dans le module download du repository /cvs/www. J'ai aussi mis un fichier dummy.tgz Voici un exemple de page qui permet le telechargement. http://jmmc.fr/~mella/files/amber-drs.htm
EOF
%ACTION{ closer="" created="2-Jan-2007" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" notify="" state="open" uid="000291" who="Main.GerardZins" }% Créer une page pour le téléchargement des 'contrib' (fftw, cfitsio, rlterm, yorick) accessible par tous.
%ACTION{ closed="26-Feb-2007" closer="" created="19-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="21-Feb-2007" notify="" state="closed" uid="000435" who="Main.EvelyneAltariba" }% Terminer l'implementation de la lecture des fichiers OI-FITS pour le calcul des visibilites calibrees et l'affichage des visibilites
%ACTION{ closed="26-Feb-2007" closer="" created="19-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="21-Feb-2007" notify="" state="closed" uid="000436" who="Main.EvelyneAltariba" }% Terminer l'implementation de l'ecriture de fichiers OI-FITS pour la sauvegardes visibilites calibrees
%ACTION{ closed="2-Mar-2007" closer="" created="19-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="26-Feb-2007" notify="" state="closed" uid="000437" who="Main.EvelyneAltariba" }% Rediger une version 'draft' du manuel utilisateur
%ACTION{ closed="26-Feb-2007" closer="" created="19-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="26-Feb-2007" notify="" state="closed" uid="000438" who="Main.EvelyneAltariba" }% Implementer la sauvegarde des visibilites non moyennees, apres selection (possibilites d'enchainer les selections)
%ACTION{ closed="2-Mar-2007" closer="" created="19-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="28-Feb-2007" notify="" state="closed" uid="000439" who="Main.EvelyneAltariba" }% Implementer la selection a partir d'une liste fournie par l'utilisateur (fournie par fichier externe)
%ACTION{ created="25-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" state="open" uid="000464" who="Main.EvelyneAltariba" }% Inclure la description du fichier de selection de frame dans le document 'VLT-SPE-AMB-15830-3984 - AMBER PRODUCT DATA SPECIFICATION'
%ACTION{ closed="23-Mar-2007" closer="" created="26-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000469" who="Main.GillesDuvert" }% Regarder et valider/corriger les calculs relatifs a la photometrie dans amdlib. Corrigé plusieurs erreurs.
%ACTION{ closed="13-Mar-2007" closer="" created="26-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000470" who="Main.EvelyneAltariba" }% Completer le header du fichier contenant la selection de frames; inclusion de l'historique
%ACTION{ closed="19-Mar-2007" closer="" created="26-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000471" who="Main.EvelyneAltariba" }% Regler le probleme des mots cles lors de noms de fichier tres long; faire du 'cropping'
%ACTION{ closed="26-Feb-2007" closer="" created="26-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="26-Feb-2007" notify="" state="closed" uid="000472" who="Main.EvelyneAltariba" }% Integrer la selection de frames dans le plugin Yorick
%ACTION{ closed="23-Mar-2007" closer="" created="26-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="23-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000474" who="Main.EvelyneAltariba" }% Reprendre les fonctions relatifs aux coordonnees UV suite aux changements faits par Gilles
%ACTION{ created="26-Feb-2007" creator="Main.GerardZins" due="9-Mar-2007" state="open" uid="000475" who="Main.EvelyneAltariba" }% Faire l'inventaire des fonctions Yorick, et decider des fonctions publiques/privees
%ACTION{ closed="3-Mar-2007" closer="" created="1-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="2-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000482" who="Main.GerardZins" }% Compiler le logiciel sur MacOs
%ACTION{ closed="21-Mar-2007" closer="Main.FlorentinMillour" created="3-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="5-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000488" who="Main.FlorentinMillour" }% Implementer le visionneur de fichier OI-FITS : FAIT !
%ACTION{ created="21-Mar-2007" creator="Main.FlorentinMillour" due="4-Apr-2007" state="open" uid="000001" who="" }% Lire les fichiers du pipeline ESO
%ACTION{ created="3-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="5-Mar-2007" state="open" uid="000489" who="Main.FlorentinMillour" }% Implementer le calcul des visibilites calibrees
%ACTION{ closed="3-Mar-2007" closer="" created="3-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="2-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000490" who="Main.GerardZins" }% Corriger la fonction BYTYPE dans le selecteur de fichiers
%ACTION{ closed="3-Mar-2007" closer="" created="3-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="2-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000491" who="Main.GerardZins" }% Corriger la selection mulitple dans le selecteur de fichiers; les traits de soulignement ne sont plus sous les fichiers selectionnes
%ACTION{ closed="3-Mar-2007" closer="" created="3-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="2-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000492" who="Main.GerardZins" }% Remettre l'affichage des science data dans la fonction amdlibShowRawData
%ACTION{ closed="3-Mar-2007" closer="" created="3-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="8-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000494" who="Main.GerardZins" }% <<EOF
Transferer (si justifie) les fonctions _amdlibGetKwdVals et _amdlibGetKeywValues dans le plugin cfitsio - La fonction _amdlibGetKeywValues() a ete supprime car non utilisee
- La fonction _amdlibGetKwdVals() doit etre mise a jour pour pourvoir etre incluse dans le plugin,
%ACTION{ created="12-Mar-2007" creator="Main.SylvainCetre" due="13-Mar-2007" state="open" uid="000564" who="Main.FlorentinMillour" }% Faire preciser le format utilisable pour la table des spectres
%ACTION{ closed="14-Mar-2007" closer="" created="12-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="13-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000570" who="Main.EvelyneAltariba" }% Mettre a jour la fonction GetAllData pour supprimer les des-allocations
%ACTION{ closed="2-Apr-2007" closer="" created="13-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="19-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000573" who="Main.FlorentinMillour" }% <<EOF
Definir le nom des fichiers et/ou arborescence pour les resultats par le DRS
Defini par Fabien
EOF
%ACTION{ closed="29-Mar-2007" closer="" created="14-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="16-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000583" who="Main.EvelyneAltariba" }% Ajouter une 'barre de progression' lors des operations prenant 'beaucoup' de temps
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000589" who="Main.EvelyneAltariba" }% Coder l'ecriture/utilisation/lecture des flags indiquant si les donnees ont un sens dans les tables oi-fits
%ACTION{ closed="23-Apr-2007" closer="" created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000590" who="Main.EvelyneAltariba" }% Envoyer un mail a FMa, FMi, GD expliquant le fonctionnement des flags + attente de validation
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000591" who="Main.EvelyneAltariba" }% Faire un vrai beau grand paragraphe sur la selection de frames dans le manuel utilisateur.
%ACTION{ closed="27-Mar-2007" closer="" created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="20-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000592" who="Main.EvelyneAltariba" }% <<EOF
Ajouter les informations relatives a la souris + a l'utilisation du browser dans le plugin yorick.
Fait dans yocoGui.i
EOF
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000593" who="Main.EvelyneAltariba" }% Finaliser le manuel utilisateur: faire des captures d'ecran sur le modele Alpha Arae, corriger les fautes d'orthographe, expliquer plus en details...
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000594" who="Main.EvelyneAltariba" }% Finir la reprise de la documentation + des regles de programmation du plugin yorick. (aide de GD+FMI?)
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000595" who="Main.EvelyneAltariba" }% Faire un script utilisant les donnees sur Alpha Arae + insertion des commandes dans le manuel utilisateur.
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000596" who="Main.EvelyneAltariba" }% Ecrire les 2 fonctions amdlibCheckDataQuality + amdlibCheckObsQuality.
%ACTION{ closed="2-Apr-2007" closer="" created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000597" who="Main.EvelyneAltariba" }% <<EOF
Aider Florentin a debugger son code - tests 2T, cas limites...
Action annulee
EOF
%ACTION{ created="19-Mar-2007" creator="Main.EvelyneAltariba" due="23-Mar-2007" state="open" uid="000598" who="Main.EvelyneAltariba" }% Faire une revue du code yorick dans son ensemble.
%ACTION{ closed="30-Mar-2007" closer="" created="22-Mar-2007" creator="Main.GerardZins" due="27-Mar-2007" notify="" state="closed" uid="000011" who="Main.GerardZins" }% Mettre a jour le wrapper Yorick et amdlibWrapper
%ACTION{ closed="23-Apr-2007" closer="" created="18-Apr-2007" creator="Main.GerardZins" due="20-Apr-2007" notify="" state="closed" uid="000051" who="Main.GerardZins" }% <<EOF
Prendre contact avec Isabelle et Pascal pour discuter des propositions de changements.
Acceuil plutot favorable de la proposition
EOF
Liste des fonctions
Evolutions à l'étude
Il apparait nécessaire de faire évoluer le format des fichiers produits par AMBER DRS pour y inclure le spectre par téléscope, et préciser la signification des données de la la tableAMBER_DATA.
Les propositions suivantes sont à discuter : - Changement des noms des colonnes de la table
AMBER_DATA-
BASE_FLUX_SUM&BASE_FLUX_SUM_CORRECTION -
BASE_FLUX_RATIO&BASE_FLUX_RATIO_CORRECTION -
BASE_FLUX_PRODUCT
-
- Ajout d'une table pour stocker le spectre par téléscope; le format de cette table doit etre discuter avec l'ESO pour adopter un format qu'il utilise deja.
- Suppression de la table
AMBER_DATAdans le produit final du DRS; seul le fichier de visibilités brutes contient cette table qui est nécessaire pour calculer les observables moyennés.
Cette proposition sous-entend la suppression des infos sur le piston!!
- Uniformisation des produits du DRS JMMC et du pipeline ESO
- Discussion de la valeur de keywords DPR pour les fichiers resultants de pipeline; en particulier 'raw vis', 'avg vis' et 'cal vis'
- Signaler le pb des keywords PRO; VALUE est utilise alors que SVALUE, DVALUE, ... sont definis
- Discuter les keyords OCS pour l'instrument contrast
- Mettre le flat field et la bad pixel en global
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Topic revision: r47 - 2007-04-23 - GerardZins
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