(r47) JmmcModelFitting < Jmmc/Software

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Bienvenue sur cette page dédiée aux activités R&D du groupe modelfitting du [[http://www.jmmc.fr][JMMC]]

%TOC%

---+ Quelques infos utiles pour utiliser ce twiki:
   * [[%TWIKIWEB%.TWikiRegistration][S'inscrire]]
   * [[%TWIKIWEB%.TWikiTutorial][Tutorial]]
   * Pour ajouter une action, insérer la ligne suivante et remplacer le nom du responsable, la date et la description de l'action.<BR>
%<nop>ACTION{ who="Main.%USERNAME%" due="2-Jan-2007" }% Description de l'action<BR>
Pour plus d'info sur le plugin de suivi des actions, voir TWiki.ActionTrackerPlugin.

---+ Description du Logiciel
Ces informations doivent etre accessibles depuis la page [[http://www.jmmc.fr/model_fitting_page.htm][Model Fitting du site web jmmc]]

---++ Format d'entree des fichiers de donnees
LITpro peut accepter plusieurs type de fichiers d'entree, mais il vaut mieux concentrer les effort en se basant sur OIFITS. Il existe un [[http://www.jmmc.fr/oival_page.htm][outil qui permet de valider les fichiers OIFITS]].

---+ Utilisation
---++ Les fichiers d'exemples 
On peut depuis la page principale [[http://www.jmmc.fr/modelfitting/][modelfitting]] accéder à l'espace de partage de fichier.

L'interface graphique peut depuis la version V1.0.11 charger l'equivalent des fichiers practices yorick...(Menu 'File'...)

Il existe egalement la possibilite de faire un rapport sur les fits obtenus a partir de fichiers settings. Liens vers les [[http://jmmc.fr/~mella/mfRes][pages protos]]

---++ Logiciel complet dans l'environnement yorick
Ce logiciel offre plus de fonctionnalites que l'interface graphique, mais necessite une installation et une utilisation dans un environnement de script avec Yorick.

<img src="%ICONURL{todo}%" width="37" height="16" alt="TODO" border="0" /> Placer et donner un pointeur sur le tgz de la distribution LITpro

<img src="%ICONURL{todo}%" width="37" height="16" alt="TODO" border="0" /> Moins urgent: indiquer comment contribuer au code.

---++ Logiciel final avec interface graphique (GUI)
| URL | Date de mise a jour LITPro  | Mise a jour  du GUI |
| [[http://www.jmmc.fr/modelfitting][La version *Stable* se lance depuis la page principale]] | TBD | Voir fichier [[http://www.jmmc.fr/modelfitting/releasenotes.htm][Releases]]| 
| [[http://jmmc.fr/~mella/ModelFitting][La page de l'interface graphique utilisateur ( Beta )]] | TBD |  Voir fichier [[http://jmmc.fr/~mella/ModelFitting/releasenotes.htm][Releases]] |

---+ Developpements
---++ Liste de diffusion et compte-rendu de réunions du groupe 
Il existe une [[http://listes.ujf-grenoble.fr/wws/info/jmmc-sw-model-fitting][liste de diffusion pour le groupe de travail modelfitting]]. Les comptes rendus de reunions circucent sur la liste mais sont aussi copiés  [[jmmcModelFittingCRReunionsDuGroupe][ici]] .

---++ Configurations logiciels supportees (ou non)
[[jmmcModelFittingListeDeConfigurations][Liste de cbnfigurations materielles/logicielles testées]]

---++ Liste d'actions 'code LITpro' :
%ACTION{ closed="2008-03-12" closer="" created="2008-02-27" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-03-07" notify="" state="closed" uid="000023" who="Main.GuillaumeMella" }% integrer les fichiers du CDS indique dans le mail d'Olivier. J'ai aussi rajoute le fichier 2007-06-29.fits
%ACTION{ closed="2008-03-18" closer="" created="2008-03-18" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-03-18" notify="" state="closed" uid="000035" who="Main.IsaTallonBosc, Main.GuillaumeMella" }% << EOF
Gerer les bornes de paramètres de modèles  

Elles devraient être indiquees dans le code source yorick comme les unités  
-- Main.GuillaumeMella - 18 Mar 2008  

Explication de l'erreur rencontrée par Olivier sur le fit des données 2007-06-29.fits (info Plantage2.txt) par une gaussienne :  
Le fitter conduit le fit où il veut, donc à des valeurs de paramètres non acceptables, comme une valeur négative pour une fwhm de gaussienne. On aurait pu mettre par ex. celle-ci en valeur absolue mais cela introduirait de la dégénérescence. On préfère ne pas "trafiquer" le paramètre mais mettre systématiquement des bornes.   
-- Main.IsaTallonBosc - 18 Mar 2008  

Le nouveau LITpro_basic  v1.18 indique les bornes et le GUI les prend en compte lors de l'echange des modeles supportes.
EOF
%ACTION{ closed="2008-03-18" closer="" created="2008-03-18" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-03-18" notify="" state="closed" uid="000036" who="Main.IsaTallonBosc" }% <<EOF
Eclairicir la description des paramètres du "elongated disk"  
Armando indique que ce n'est pas très clair si le "axis ratio" est le grand axe sur le petit ou vice-versa. 

Pourtant bien défini mais mieux mis en évidence dans la doc de la fonction dans la nouvelle version. 
-- Main.IsaTallonBosc - 18 Mar 2008
EOF
%ACTION{ closed="2008-04-01" closer="" created="2008-03-11" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-01" notify="" state="closed" uid="000053" who="Main.IsaTallonBosc" }% <<EOF
Conclusion d'Armando sur ses tests - rapport du 11-03-08 -:  problème avec le calcul des
fréquences spatiales, qui semblent incorrectes sur un ensemble de données fittées avec d'autres données.
Conclusion confirmée : les fréquences spatiales des mesures dans la bande K étaient
calculées avec la longueur d'onde du dernier ensemble de données (en H).
Bug corrigé dans oidata.i 
Les fits alors obtenus sont compatibles avec ceux attendus.
-- Main.IsaTallonBosc - 1 April 2008
EOF
---++ Liste d'actions 'GUI':
%ACTION{ closed="2008-06-12" closer="" created="2008-02-27" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-03-07" notify="" state="closed" uid="000546" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Implementer le plot des residus au niveau du GUI,  (possibilité de choisir VIS VIS2 ou  T3).  
C'est fait cote serveur (code yorick et enrobage).
EOF
%ACTION{ closed="2008-06-11" closer="" created="2008-03-18" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" notify="" state="closed" uid="000037" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Prevoir un unload d'oifile:  
Ce n'est pas très évident et a priori pas indispensable.  
Dans quel cas est-ce vraiment utile? 

Reportee, puisqu'il n'y a pas de reel  besoin...
EOF
%ACTION{ closed="2008-06-12" closer="Main.GuillaumeMella" created="2008-03-18" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" state="closed" uid="000038" who="Main.GuillaumeMella" }% Rafraichir l'arbre lorsqu'un model est supprimé dans le panneau 'target panel'
%ACTION{ closed="2008-09-25" closer="" created="2008-03-18" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" notify="" state="closed" uid="000039" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Faire fonctionner le 'run fit' lorsqu'un model est supprimé dans le panneau 'target panel' 
Le probleme ne semble plus se presenter dans la version 1.0.11beta
EOF
%ACTION{ closed="2008-06-12" closer="Main.GuillaumeMella" created="2008-03-18" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" state="closed" uid="000040" who="Main.GuillaumeMella" }% Faire bien apparaître la liste de modèles au premier clique.(actuellement il en faut deux)
%ACTION{ closed="2008-04-09" closer="" created="2008-04-03" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" notify="" state="closed" uid="000055" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Regarder le probleme avec le fichier 2007-06-29.fits 
Ok il y avait un bout de code "non solicité" qui modifiait automatiquement l'ident... 
Bug resolu depuis la version 1.0.10
EOF
%ACTION{ closed="2008-06-11" closer="Main.GuillaumeMella" created="2008-04-03" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" state="closed" uid="000056" who="Main.GuillaumeMella" }% Optimiser le probleme de lenteur du panneau 'result'
%ACTION{ closed="2008-09-25" closer="" created="2008-04-03" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-04-18" notify="" state="closed" uid="000057" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Gerer la fonction de normalisation pour le fit 
Reste a mettre la valeur par defaut a 'TRUE'
EOF
%ACTION{ created="2008-06-12" creator="Main.GuillaumeMella" due="2008-07-18" state="open" uid="000052" who="Main.GuillaumeMella" }% Gerer l'affichage des plots de resultats avec l'enchainement de plusieurs fits.
%ACTION{ created="2008-06-16" creator="Main.GuillaumeMella" due="" state="open" uid="000059" who="Main.GuillaumeMella" }% Mettre en evidence le fait que le GUI fait un traitement long ( barre de progression sablier...).
%ACTION{ closed="2008-09-24" closer="" created="2008-06-19" creator="Main.GuillaumeMella" due="" notify="" state="closed" uid="000060" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Fixer le bug du navigateur de fichier sous Mac OS X  qui ne pointe pas vers le homedirectory 
Bug fixé
EOF
%ACTION{ closed="2008-11-13" closer="" created="2008-06-19" creator="Main.GuillaumeMella" due="" notify="" state="closed" uid="000061" who="Main.GuillaumeMella" }% <<EOF
Fixer la taille de la fenetre d'erreur 
Elle est plus petite, et le contenu et trie pour simplifier l'analyse de l'utilisateur
EOF

---+++ Points concernant LITpro 
   * Pourquoi le fit ne marche pas si on fixe le paramètre "weight" ? En plus, pour faire le fit de visibilités avec un modèle unique (un disque uniforme par exemple) ce paramètre n'est pas nécessaire et ne devrait pas compter comme un paramètre libre.
-- Main.ArmandoDomiciano - 11 Mar 2008<br />
 Le fit  marche, avec paramètre "i1" fixe ou libre, avec ou sans normalisation. Donc remarque à préciser car non reproduite. <br />
-- Main.IsaTallonBosc - 01 Apr 2008<br/>

---++++ Enquete noms de parametre des modeles
Suite à des echanges de mail les nouveaux noms de parametres ont étés definit. Il reste a faire l'integration dans le code yorick.

---+ Retours sur les donnees partagees

Pour des retours sur des essais realisés avec les [[http://jmmc.fr/oidata][donnees partagees]], il existe un page dediee au [[JmmcModelFittingFeedBack][retour d'experience]].
Topic revision: r47 - 2008-11-28 - GuillaumeMella